Syngenta hadir di Indonesia semenjak tahun 1960an, berkantor pusat di Jakarta dan memiliki tiga wilayah komersial, yaitu: Jawa, Sumatera, dan Indonesia bagian Timur. Syngenta Indonesia memiliki karyawan lebih dari 800 orang, dengan tiga fasilitas yaitu Pusat Riset dan Pengembangan yang berlokasi di Cikampek, Pabrik produksi produk perlindungan tanaman di Gunung Puteri, Pabrik pemrosesan benih di Pasuruan dan Pabrik pengembangan benih di Kediri.